Audi hat 2003 die zweite Generation des A3 auf den Markt gebracht und nur ein Jahr später, im Juni 2004, den Fünftürer mit leicht veränderter Front vorgestellt.
Die fünftürige Version wurde in der Mitte des Lebens der ersten Generation des A3 eingeführt, nachdem Audi verstanden hatte, dass seine Kunden es kaufen würden, und sie taten es. Das Auto war ein großer Erfolg. Aber die zweite Generation begann mit langsamen Verkäufen, und der deutsche Autohersteller musste schnell etwas tun, um das zu beheben.
Im Jahr 2004 änderte der Autohersteller zusammen mit der Einführung des Audi A3 Sportback (der fünftürigen Version) die Frontverkleidung des Autos. Der Singleframe-Grill wurde höher und die neuen Scheinwerfer sahen ansprechender aus. Beide Stoßstangen mussten geändert werden, um dem neuen Design zu entsprechen. Die fünftürige Version war außerdem um 80 mm (3,14 Zoll) länger, um Platz für die Fondpassagiere zu bieten. Aber es gab nicht allzu viel Platz für ihre Bein- und Kopffreiheit. Wie bei den meisten Facelift-Fahrzeugen wurden die Rücklichter modifiziert.
Im Innenraum dominierte Audi-Qualität, aber auch dunkle Farben und silberne Zierleisten. In Bezug auf das logische Layout war alles so, wie man es erwarten würde, aber es hatte nicht die Attraktivität eines Alfa 147. Der A3 galt als Premium-Golf von Volkswagen, da er auf derselben Plattform basierte.
Alle Fahrzeuge mussten ab 2005 die Euro-4-Motoren erfüllen, und das war die größte Änderung für die Audi A3-Reihe von 2005. Die Basisversion war mit einem 1,6-Liter-Saugbenziner ausgestattet, der nur 102 PS leistete. Für die Dieselfans war die Basis das 1,9-Liter-TDI-Aggregat. Die meisten mit Dieselmotoren ausgestatteten Autos waren Gegenstand des Dieselgate-Skandals.