Ford führte das erste Facelift für die zweite Generation des Mondeo im Jahr 2003 ein, nur zweieinhalb Jahre nach seiner Markteinführung, im November 2000.
Während er in einigen Ländern noch Marktführer war, erhielt der Mondeo MKII im Sommer 2003 ein Update. Der Autohersteller führte neue Funktionen und einige Änderungen im Innenraum ein. Die Änderung war für den Antriebsstrang nicht erforderlich, da die folgenden Schadstoffnormen 2005 eingeführt wurden, als Ford das zweite Facelift für ein Auto auf den Markt brachte, das nur sieben Jahre auf dem Markt hielt.

Von außen war die einzige wahrnehmbare Änderung der Kühlergrill, der eine Chromumrandung und ein Gitter aus Wabengitter aufwies. Auch der Stoßfänger wurde durch die Einführung größerer Nebelscheinwerfer in verschiedenen Gehäusen verbessert. An den Seiten waren die an den Kotflügeln angebrachten Blinker transparent statt orange. Auf der Rückseite waren die Rücklichter mit transparenten Gläsern für die Blinker des Modelljahres 2003 anstelle von Rot ausgestattet.

Im Inneren verbesserte oder änderte Ford einige Teile, um die Qualität des Autos zu verbessern. Zum Beispiel unterzeichnete es einen Vertrag mit Sony über die Lieferung der CD-Radioeinheit, die viel besser in die Mittelkonsole integriert war. Andere Tasten und Schalter erhielten ein verbessertes Design.

Bei der Motorenpalette wagte sich Ford an die Einführung eines 3,0-Liter-V6-Benziners für die Topversion. Da der europäische Dieselmarkt wächst und für Flotten sehr attraktiv wird, rüstet die blau-ovale Marke den 2,0-Liter-TDCI-Motor auf 155 PS auf, 25 PS mehr als sein Vorgänger.