Die zweite Generation des Mondeo Wagon kam im Jahr 2000 auf den Markt und bot einen der größten Kofferräume in seinem Pkw-Segment.
Bald nach seiner Einführung wurde der Mondeo in mehreren Ländern zum Marktführer. Sein neues Design war weit entfernt von seinem Vorgänger. Es war ein völlig neues Designkonzept mit dem Namen „New Edge Design“. Aber Ford musste einige Opfer bringen und verbesserte das Auto zweimal: 2003 und 2005.

Äußerlich wies der Mondeo Wagon vorne einen Gittergrill und dreieckige, nach hinten gekehrte Scheinwerfer auf. Im unteren Stoßfängerbereich wurde ein unterer Kühlergrill mit zwei Lamellen installiert. Je nach gewählter Ausstattung installierte Ford Nebelscheinwerfer in der vorderen Stoßstange. Nach der B-Säule wies der Mondeo Wagon ein längeres Dach auf, um den größeren Kofferraum unterzubringen. Er maß 540 Liter (19 cu-ft) bei hochgeklappten Sitzen, während er bei umgeklappten Rücksitzen bis zu 1700 Liter (60 cu-ft) erreichte.

Obwohl der Mondeo als Flaggschiff für den europäischen Markt galt, versuchte Ford nicht, ihn anders aussehen zu lassen. Es verfügte über ein Soundsystem mit Kassettenspieler und eine einfache Radiofunktion. Das Design der Tasten lag deutlich unter dem Ziel des Autos.

Ford installierte eine sehr große Auswahl an Motoren, sowohl mit Benzin als auch mit Diesel. Für ausgewählte Versionen bot der Autohersteller ein Automatikgetriebe an.