Der Kombi Mondeo MKII wurde von seinen Kunden aufgrund seines großen Kofferraums sehr geschätzt.
Es erhielt das erste Facelifting im Jahr 2003, zusammen mit dem Rest des Sortiments.
Während er in einigen Ländern noch Marktführer war, erhielt der Mondeo MKII im Sommer 2003 ein Update. Der Autohersteller führte neue Funktionen und einige Änderungen im Innenraum ein. Die Änderung war für den Antriebsstrang nicht erforderlich, da die folgenden Schadstoffnormen 2005 eingeführt wurden, als Ford das zweite Facelift für ein Auto auf den Markt brachte, das nur sieben Jahre auf dem Markt hielt.
Von außen war die einzige wahrnehmbare Änderung der Kühlergrill, der eine Chromumrandung und ein Gitter aus Wabengitter aufwies. Auch der Stoßfänger wurde durch die Einführung größerer Nebelscheinwerfer in verschiedenen Gehäusen verbessert. An den Seiten waren die an den Kotflügeln angebrachten Blinker transparent statt orange. Nach der B-Säule wies der Mondeo Wagon ein längeres Dach auf, um den größeren Kofferraum unterzubringen. Er maß 540 Liter (19 cu-ft) bei hochgeklappten Sitzen, während er bei umgeklappten Rücksitzen bis zu 1700 Liter (60 cu-ft) erreichte.
Im Inneren verbesserte oder änderte Ford einige Teile, um die Qualität des Autos zu verbessern. Zum Beispiel unterzeichnete es einen Vertrag mit Sony über die Lieferung der CD-Radioeinheit, die viel besser in die Mittelkonsole integriert war. Andere Tasten und Schalter erhielten ein verbessertes Design.
Für die Motorenpalette führte Ford einen 3,0-Liter-V6-Benziner für die Top-Version ein. Da der europäische Dieselmarkt wächst und für Flotten sehr attraktiv wird, rüstet die blau-ovale Marke den 2,0-Liter-TDCI-Motor auf 155 PS auf, 25 PS mehr als sein Vorgänger.