Im Dezember 1998 führte Ford ein bedeutendes Facelifting für die vierte Generation des Mustang ein, das eine neu gestaltete Karosserie und verbesserte Antriebsstränge umfasste.
Ford führte das neue Designthema im Automobilbereich ein. Der aufgefrischte Mustang hatte mit der Einführung der neuen Designelemente ein maskulineres Aussehen. Leider wollte der amerikanische Autobauer die starre Hinterachse nicht loswerden, die für einen Sportwagen von 1999 völlig veraltet war.
Während der ‘Stang von 1994 keine gerade Linie auf seiner Karosserie aufwies, war das ‘99er Modell fast das Gegenteil. Eckige Scheinwerfer und Rücklichter, scharfe Kanten an Motorhaube und Seiten sowie ein extravaganter Lufteinlass an den hinteren Kotflügeln. Aber einige würden das gleiche Gewächshausdesign und bei den Cobra-Versionen die Kuppel auf der Motorhaube bemerken.
Im Inneren waren die abgerundeten Linien immer noch vorhanden, mit einem wellenförmigen Armaturenbrett, das dem ursprünglichen Design des 1964er ½ Mustang-Panels ähnelte, aber mit einem tiefen Mittelstapel, der sich bis zur Mittelkonsole erstreckte. Die vorderen Schalensitze wurden für Komfort gebaut, aber der Autohersteller bot als Option ein Paar mit höherer Polsterung an. Hinten war etwas Platz für zwei Erwachsene, aber mit minimaler Kopffreiheit. Da die Hinterachse weit von der Komfortzone entfernt war, hätte jede Unebenheit auf der Straße zu einem Hirnschaden führen können.
Ford installierte den 3,8-Liter-V6-Motor für das Basismodell in Verbindung mit einem 5-Gang-Schaltgetriebe unter der Motorhaube. Seine Leistung wurde im Vergleich zum Vorgänger um 45 PS gesteigert und erreichte 190 PS. Beim 4,6-Liter-V8 wurde die Leistung von 215 PS auf 260 PS angehoben. Später leistete die Cobra-Version bis zu 320 PS aus demselben Aggregat.