Nach vier Jahren auf dem Markt führte Jaguar eine Mid-Life-Cycle-Auffrischung für den S-Type ein und machte ihn Euro-5-konform.
Der S-Type war der erste wichtige Schritt von Jaguar, seit Ford ihn gekauft hatte, aber die dafür verwendete amerikanische Plattform war weit entfernt von dem, was das britische Auto einst war. Seine Kunden waren damit nicht sehr zufrieden, und der Einbau von Dieselmotoren brachte die Puristen zum Weinen. Aber es waren die 2000er Jahre und die Turbodieselmotoren machten mehr als die Hälfte der europäischen Autoverkäufe aus.

2004 unternahm Jaguar einen weiteren Schritt zur Verbesserung des Autos, das die Marke retten sollte. Seine Gesamtform blieb unverändert, aber die Scheinwerfer waren komplett neu und enthielten eine Klarglastechnologie, die das Licht verbesserte. Die Stoßstange hatte unten einen breiteren Kühlergrill und integrierte die runden Nebelscheinwerfer. Am Heck gab es nur eine leichte Umformung der Stoßstange.

Drinnen war eine andere Geschichte. Obwohl das Auto mit einigen Ford-Knöpfen und -Schaltern ausgestattet war, sah es frisch aus. Ein komplett neues Armaturenbrett mit rechteckigen Lufteinlässen. In der Mittelkonsole führte Jaguar ein Infotainmentsystem mit Satellitennavigation und einem Farbbildschirm ein. Das J-Muster für den Automatikgetriebewähler blieb unverändert.

Unter der Motorhaube führte Ford einen 2,5-Liter-V6-Motor ein, der vom Mondeo übernommen wurde, und einen 2,7-Liter-Turbodiesel, der im Land Rover Discovery verwendet wurde.