Der Mazda Xedos 9 erhielt sein letztes Facelifting im Jahr 2001, ein Jahr bevor er eingestellt wurde.
Das Modell von 2001 war mit einem weniger leistungsstarken 2,5-Liter-V6-Motor ausgestattet, der jetzt 165 PS leistet, verglichen mit den 170 PS des Vorgängers. Außerdem wurde das Fahrgestell des Autos verstärkt und die neue Aufhängung verstärkt, während sie mit größeren Rädern ausgestattet wurde. Der neue Mazda Xedos 9 war mit neu gestalteten Scheinwerfern ausgestattet und erfuhr mehrere weitere Änderungen im Innenraum, darunter eine neue Mittelkonsole und 4 Airbags (statt zwei wie beim Vorgängermodell). Das Auto wurde 2002 eingestellt.