Skoda stellte den Fabia 1999 auf der IAA in Frankfurt vor.
Er teilte seine Plattform mit dem Seat Ibiza und dem Volkswagen Polo Mk IV. Im folgenden Jahr stellte der tschechische Autobauer die Kombi-Version vor.

Skoda Fabia Combi war das kleine Auto mit einer Kompaktsegment-Attitüde. Combi war der Name, der von den meisten osteuropäischen Ländern für die Karosserieformen von Kombis verwendet wurde, und die tschechische Marke verwendete ihn für die Feliceia-Reihe, bevor der Volkswagen Konzern ihn kaufte.

Fabias Design war im tschechisch-kubistischen Stil mit eckigen Formen, einschließlich der Scheinwerfer und des Kühlergrills. Mit seiner gewölbten Dachlinie war der Rest des Autos modern und von den neuen Designtrends in der Automobilindustrie diktiert. Im Gegensatz zum Seat Ibiza Vario (Kombi) hatte der Fabia Combi eine gewölbte Heckklappe.

Im Inneren hatte das Auto das gleiche geschwungene Armaturenbrett wie der Fabia-Fließheck. Die einzigen rechteckigen Elemente an Bord waren die Lüftungsdüsen. Ein leicht lesbares und verständliches Kombi-Instrument verfügte über unterschiedliche Zifferblätter für Tachometer und Drehzahlmesser sowie oben montierte Anzeigen für Kraftstoffstand und Kühlmitteltemperatur. Vorne waren die Sitze mit einigen Anpassungen einfach. Der Autobauer installierte hinten eine geteilte Klappbank, die den Kofferraum von seinen standardmäßigen 530 Litern (18,7 cu-ft) auf 1395 Liter (49,2 cu-ft) erweitern konnte.

Unter der Motorhaube installiert Skoda eine Auswahl von vier Benzin- und fünf Dieselmotoren. Alle waren mit einem 5-Gang-Getriebe gekoppelt.