Модель E46 M3 от BMW была представлена в 2000 году и имела два варианта кузова: 2-дверное купе и 2-дверный кабриолет.
M3 Coupe получил выгоду от недавно разработанного 3,2-литрового двигателя BMW S54, без наддува, который развивает мощность 343 л.с. и крутящий момент 273 фунт-фут. Эти силовые установки нового поколения сочетались либо с инновационной трансмиссией SMG Drivelogic с подрулевыми переключателями (как в ралли), либо с новой 6-ступенчатой коробкой передач. Из-за более строгих правил выбросов CO2 эта модель поставлялась на рынок Северной Америки с двигателем мощностью на 5 л.с. ниже. Производство E46 M3 Coupe было прекращено в 2006 году, уступив место BMW M3 4-го поколения годом позже.