Mazda Xedos 9 в последний раз подверглась фейслифтингу в 2001 году, за год до того, как производство было прекращено.
Модель 2001 года была оснащена менее мощным двигателем V6 объемом 2,5 л, который теперь развивает мощность 165 л.с. по сравнению со 170 л.с., обеспечиваемыми предыдущим агрегатом. Также было усилено шасси автомобиля и усилена новая подвеска, а также установлены колеса большего размера. Новая Mazda Xedos 9 отличалась переработанными фарами и претерпела ряд других внутренних изменений, в том числе новую центральную консоль и 4 подушки безопасности (вместо двух, как в предыдущей модели). Автомобиль был снят с производства в 2002 году.