Рестайлинг 1999 года привел к ряду изменений и дополнений в модельном ряду как для кузова купе, так и для кузова кабриолет.
Первый получил новую модель с двигателем V8 объемом 4,3 л, а также получил многочисленные обновления, включая систему ESP, а также перенастроенную подвеску и большие тормоза. Слегка физически переработанный CLK катился на более крупных 17-дюймовых колесах, а его коэффициент лобового сопротивления был снижен для еще более агрессивной езды. Были сохранены некоторые функции, которые можно было увидеть в версиях до фейслифтинга, такие как антиблокировочная система тормозов в сочетании с системой помощи при экстренном торможении. опциональная бесключевая противоугонная система зажигания.