2004 yılında Audi A3, tamamen yeni bir ön uç, büyük ızgara, yenilenmiş farlar, yeni tamponlar ve yeni jantlar ve dış kaplamalarla gelen bir güncelleme aldı.
Beş kapılı versiyonuna Sportback adı verildi, sadece onu hatchback adlı üç kapılı versiyondan ayırt etmek için.

Audi A3’ün ikinci nesli 2003 Cenevre Otomobil Fuarı’nda piyasaya sürüldü. Yeni bir platforma dayanıyordu ve Haziran 2004’te beş kapılı Sportback versiyonu piyasaya sürüldü. Hatchback segmentinde Sportback, beş kapı sunan tek premium otomobildi. BMW 3 Serisi Compact ve Mercedes-Benz Sportcoupe sadece üç kapılı versiyonlarda mevcuttu.

Walter da Silva imzalı yeni bir tasarım vardı ancak Audi A8 W12’de ilk kez tanıtılan yeni ön ızgarayı içeriyordu. 3 kapılı versiyonla karşılaştırıldığında, A3 Sportback daha uzun dingil mesafesi nedeniyle 80 mm (3,14”) daha uzundu. Çatıda, müşteri bir çift gümüş tavan rayı seçebilir. Arkaya yeni bir tampon ve A4 tarzı arka farlar takılmıştı. Üçüncü stop lambası, küçük çatı spoylerine yerleştirildi.

İçeride beş yolcu için yer vardı. Otomatik klima kontrolü, yeni bir yarı otomatik şanzıman gibi birinci sınıf olanaklara sahip birinci sınıf kompakt boyutlu bir araçtı. Deri koltuklar ve spor koltuklar bir seçenek olarak veya belirli modellerde standart olarak sunuldu.

Rakipleriyle karşılaştırıldığında, A3 Sportback dört tekerlekten çekiş sistemleriyle mevcuttu.