Yüksek performanslı bir Z3 modeli, BMW tarafından 1998’de M Roadster olarak tanıtıldı.
Daha güçlü motorların yanı sıra - 321 hp sunan güncellenmiş M3 modellerinden ödünç alınan 3.2L üniteler - yeni M Z3 Roadster, yeniden tasarlanmış bir egzoz sistemine, aerodinamik bir gövde şekline, revize edilmiş frenlemeye ve yeni bir şanzımana sahipti. Bu model hem Avrupa hem de Kuzey Amerika için mevcuttu. ABD-hızlı modeller, 2001 yılında bir motor güncellemesi aldı ve güçlü bir 315 hp 3.2L S54 ünitesi ve 5 vitesli bir manuel şanzıman ile donatıldı. BMW Z3 M Roadster, yaklaşık 15.000 adet üretildikten sonra 2002 yılında durduruldu.