Mühendislik ekibi tarafından birçok tereddüt, mücadele ve dökülen galon kahvenin ardından Fiat, nihayet 2003 yılında Panda’nın ikinci neslini getirdi.
Bu sefer İtalyan otomobil üreticisi doğru olanı yaptı ve en başından itibaren 4x4 versiyonunu sundu. Yine de bu kolay bir iş değildi, çünkü mühendisler en başından itibaren dört tekerlekten çekiş sistemiyle başa çıkabilecek bir platform üzerinde çalışmak zorundaydılar. Panda’nın ikinci neslinin ertelenmesinin ve Fiat’ın ilk nesli on iki yıl boyunca piyasada tutmasının sebeplerinden biri bu olabilir.

Panda’nın ikinci nesil görünümünden Centro Stile Fiat sorumluydu. Her şey sıfırdan başladı ve tasarım ekibi önceki nesilden hiçbir şey almadı. Hala kutu orantılarını kullanırken, keskin köşeleri veya düz çizgileri yoktu. Sadece farlar ve ızgara dikdörtgen bir görünüme sahipti. Tampon siyah bir orta alana sahipti. Alt gövdeyi korumak için plastik bir kalkanı taklit ediyordu ama bu sadece bir tasarım meselesiydi. Yanlarından, kapılardaki ve tekerlek davlumbazlarındaki siyah kalıplar, bazı off-road yeteneklerine neden oldu.

İçeride Fiat, diğer Panda’larla aynı kabini, bazı renk değişiklikleri ve döşeme seçenekleriyle kurdu. Yüksek sera nedeniyle, önde kova koltukları ve arkada profilli, ikiye katlanan bir bank ile dört yetişkin için yeterli alan vardı.

Fiat, Panda MKI üzerindeki teknik platformu büyük ölçüde geliştirdi. Elektronik olarak kontrol edilen bir merkez diferansiyeline ve özellikle kaygan yüzeyler için ayarlanmış bir ESP’ye sahipti. Bu, küçük arabanın diğer birçok saygın arazi aracından daha kolay karlı veya çamurlu yüzeylere tırmanmasına yardımcı oldu.