Nissan, 1999 yılında Primera’nın ikinci neslini yeniledi ve otomobil üreticisi, 600’den fazla parçayı değiştirdiğini ve ana rakiplerinden çok daha yüksek bir seviyeye çıkardığını iddia etti.
Değişiklikler, istasyon vagonu da dahil olmak üzere tüm gövde versiyonlarını etkiledi. Nissan Europe araca odaklandı, yeniden şekillendirdi ve aracı eski kıtanın dar sokaklarına ve yollarına uygun hale getirmek için Almanya ve Birleşik Krallık’ta bazı mühendislik değişiklikleri ekledi.

Dış kısımda, otomobil üreticisi yeni bir ızgara tanıttı, yeniden şekillendirilmiş kanatları ızgara olarak spor yaptı. Farları neredeyse yok olan biyo-tasarım trendini takip ederek yeniydi. Ayrıca Xenon farlar için bir seçenek sundu ve bu, tamponda standart bir yıkayıcı ile geldi. Tamponun alt tarafında, otomobil üreticisi iki sis lambasının çevrelediği geniş bir ızgaraya yer verdi. Arkada, station wagon için ana değişiklik arka farlardaydı. Geliştirildiler ve ayrıca yeni bir koruyucu cam aldılar.

İçeride, otomobil üreticisi değişikliklerine devam etti. Orta konsol, her araç için benzersiz olan özel bir ses sistemine sahipti. Bu nedenle, onları çalmak işe yaramazdı. Opsiyonel olarak bagaja 10 CD değiştirici eklendi ve ses sistemi paneli üzerinden kontrol edildi. Nissan ön koltukları değiştirdi ve onları oyulmuş bir sırtla yeniden şekillendirdi. Böylece, otomobil üreticisinin arka koltuktaki yolcular için diz mesafesini 5 cm (2”) artırmasını sağladı. Ancak bagaj alanı, arka sıra yukarıdayken 430 litre (15.2 cu-ft) ve arka koltuk arkası katlanmış durumdayken 1.650 litreye (58.3 cu-ft) kadar aynı kaldı.

Kaputun altında iki önemli yenilik vardı: 1.8 litrelik bir motor ve 2.0 litrelik motor için bir CVT şanzıman.