Skoda Fabia’nın 1999 modeli, Fabia Sedan takma adı verilen 4 kapılı bir sedan, 5 kapılı hatchback ve Fabia Combi olarak da adlandırılan 5 kapılı bir arazi dahil olmak üzere birden fazla gövde stilinde mevcut olan otomobilin ilk neslini temsil ediyor.
İlk nesil, Eylül 1999’da Frankfurt Otomobil Fuarı’nda resmi olarak tanıtıldı ve bir ay sonra üretime başlandı. Fabia, 1.2 benzinli ve 2.0 dizel arasında değişen, 55 ila 115 beygir gücü üreten birden fazla motor konfigürasyonunda geldi. Skoda Fabia’nın küçük sınıfta Ford Fiesta, Fiat Punto, Citroen C3, Peugeot 206 ve Renault Clio gibi birçok rakibi vardı.