El modelo E46 M3 de BMW se introdujo en 2000 y presentaba dos estilos de carrocería: cupé de 2 puertas o convertible de 2 puertas.
El M3 Coupe se benefició del motor 3.2L S54 recientemente desarrollado por BMW, de aspiración natural, que brinda 343 PS y 273 lb-ft de torque. Estos motores de nueva generación se combinaron con una innovadora transmisión SMG Drivelogic, con paletas de cambio montadas en el volante (similar a un rally), o una nueva caja de cambios de 6 velocidades. Debido a las normas más estrictas sobre emisiones de CO2, este modelo vino con una potencia de motor 5 hp más baja en el mercado norteamericano. El E46 M3 Coupe se suspendió en 2006, dejando espacio para la cuarta generación de BMW M3 un año después.