El lanzamiento de 2002 del modelo de rostro levantado trajo pocas modificaciones externas al cuerpo además de las internas.
Se agregó una versión HDI con common rail para el 1.9 Diesel, así como algunas versiones HDI de los motores de gasolina 1.4, 1.6 y los motores 2.0 recientemente agregados.

Las tendencias de motores más limpios obligaron a Peugeot a reducir las emisiones dotando a sus vehículos de mejores filtros de partículas y catalizadores y, en este sentido, el nuevo 206 era menos contaminante que el anterior. Sensible y seguro, el 206 también obtuvo 4 de 5 estrellas en seguridad para ocupantes adultos en las pruebas EuroNCAP.