Skoda presentó la segunda generación del Octavia en el Salón del Automóvil de Ginebra de 2004 en ambas versiones de carrocería, hatchback y familiar, continuando la historia de éxito de su predecesor.
Cuando Volkswagen decidió comprar la marca checa Skoda, trató de convertirla en una marca de mercado masivo, asequible y confiable como un Golf. La primera generación del Octavia tuvo mucho éxito y se vendió en todo el mundo. La segunda generación siguió la misma receta, utilizando la plataforma del Golf (PQ35), y ofreció al vehículo una amplia variedad de motores y opciones.

Desde el exterior, la segunda generación era muy similar a su predecesora. El diseño general adoptó algunos detalles cubistas con líneas rectas y bordes estrechos, como los faros y las señales de giro inclinadas hacia abajo montadas en las esquinas. Un borde cromado rodeaba su parrilla cuadrada con listones verticales. Según las opciones y el nivel de equipamiento, el Octavia Combi presentaba un par de luces antiniebla en la parte inferior del parachoques. Desde sus lados, el largo invernadero se extendía sobre el área del maletero con una línea de techo ligeramente curvada que dejaba espacio para la tercera fila de ventanas instaladas sobre los paneles de los cuartos traseros. Al igual que en su predecesor, el fabricante de automóviles instaló las luces traseras fuera del área del portón trasero, mientras que la ventana trasera presentaba una tercera luz de freno en la parte superior.

El diseño limpio y claro con superficies ligeramente curvas y adornos grises rectos hizo que el auto pareciera más en el segmento de precio medio que en los autos económicos. Era algo más cara que su antecesora, pero los materiales empleados eran de mejor calidad. El Octavia II Combi presentaba un tamaño de maletero de 580 litros (20,5 pies cúbicos) que podía ampliarse hasta la asombrosa cantidad, para su clase, 1620 litros (67,8 pies cúbicos) plegando completamente el banco trasero.