El fabricante de automóviles checo Skoda actualizó la línea Superb en 2006, agregando algunos cambios menores en el exterior y mejorando su línea de motores.
Dado que ya era propiedad de Volkswagen, Skoda recibió acceso a nuevas tecnologías y plataformas, y el Superb recibió una versión de distancia entre ejes 10 cm (3,9 “) más larga que la base del Passat.

El exterior del automóvil se parecía mucho al Passat alemán, y el fabricante de automóviles intentó agregar algunos cambios sutiles para que los dos hermanos no se vean iguales, al menos desde el espejo retrovisor. Entonces, se cambió la fascia delantera y el Superb recibió nuevos faros y una nueva parrilla con listones negros verticales. Era la nueva parrilla corporativa que ya estaba instalada en sus hermanos menores, el Fabia y el Roomster. En la parte trasera, Superb presentaba nuevas luces traseras con un área clara cuadrada alrededor de una parte roja para las luces direccionales y de marcha atrás.

Dentro de la cabina, las principales diferencias se centraron en el puesto de conducción. Dentro del grupo de instrumentos, los diseñadores instalaron nuevas letras para los diales. Entre ellos, el fabricante de automóviles mantuvo la pantalla LCD para la computadora de a bordo. Skoda instaló un nuevo panel de plástico para la consola central, que se veía tan bien como uno instalado en un Audi A6. Fue un gran paso adelante para el aspecto del coche. Gracias a su mayor distancia entre ejes, había tanto espacio como un Audi A8 en los asientos traseros.

Skoda dejó caer el turbodiésel de 1.9 litros debajo del capó y lo reemplazó con una unidad de 2.0 litros que desarrolló más potencia y funcionó de manera más limpia. Además, hizo su aparición un turbodiésel de 2.5 litros.