Audi a lancé le modèle S3 de première génération en 1999.
Cette version plus sportive de l’Audi A3 partageait sa plate-forme A avec des voitures comme l’Audi TT ou la Seat Leon et était équipée d’un moteur à essence turbocompressé de 1,8 L développant 210 ch. Cette variante désaccordée du moteur de l’Audi TT a ensuite reçu une augmentation de puissance de 15 ch grâce à un nouveau système de calage variable des soupapes. Les nouvelles fonctionnalités comprenaient un contrôle électronique de la traction / programme de stabilité, des phares au xénon, la climatisation, un régulateur de vitesse en option et des sièges avant chauffants. L’Audi S3 d’entrée de gamme a reçu son premier - et unique - lifting en 2001, lorsqu’elle a subi quelques légères modifications sur sa conception avant et latérale.