Skoda a présenté la Fabia en 1999 au salon de l’automobile de Francfort.
Elle partageait sa plateforme avec la Seat Ibiza et la Volkswagen Polo Mk IV. L’année suivante, le constructeur tchèque lance la version break.

Skoda Fabia Combi était la petite voiture avec une attitude de segment compact. Combi était le nom utilisé par la plupart des pays d’Europe de l’Est pour les formes de carrosserie des breaks, et la marque tchèque l’a utilisé sur la gamme Feliceia, avant que le groupe Volkswagen ne l’achète.

Le design de Fabia était dans le style du cubisme tchèque, avec des formes angulaires, y compris les phares et la calandre. Avec sa ligne de toit arquée, le reste de la voiture était moderne et dicté par les nouvelles tendances de design de l’industrie automobile. Contrairement à la Seat Ibiza Vario (break), la Fabia Combi était dotée d’un hayon arqué.

À l’intérieur, la voiture présentait le même tableau de bord incurvé que la Fabia à hayon. Les seuls éléments rectangulaires à bord étaient les bouches d’aération. Un groupe d’instruments simple à lire et à comprendre comportait des cadrans distincts pour l’indicateur de vitesse et le tachymètre et des jauges montées sur le dessus pour le niveau de carburant et la température du liquide de refroidissement. A l’avant, les sièges étaient simples, avec quelques réglages. Le constructeur automobile a installé une banquette rabattable à l’arrière, qui pouvait étendre le coffre de ses 530 litres standard (18,7 pieds cubes) à 1395 litres (49,2 pieds cubes).

Sous le capot, Skoda a installé un choix de quatre moteurs à essence et cinq moteurs diesel. Tous étaient couplés à une boîte de vitesses à 5 rapports.