O Audi S6 2006 recebeu também uma versão station-wagon.
Era o modelo com o maior motor a gasolina já instalado dentro de uma carcaça A6, sedã ou perua.

Na grande grade de quadro único com detalhes cromados para o aro e barras verticais, o emblema S6 vermelho e prata ficou discretamente. Cinco LEDs de cada lado, instalados sob os faróis, contavam uma história: um LED para cada cilindro sob o capô. Havia alguns outros detalhes, como emblemas V12 nos pára-lamas e caixas de espelho retrovisores prateadas, mas a última coisa que a maioria dos outros motoristas na estrada veria eram os quatro escapamentos ovais bem integrados ao pára-choque traseiro. O porta-malas era amplo, com 546 litros (19,2 pés cúbicos) de espaço, que podiam ser estendidos até 1660 litros (70,3 pés cúbicos) de espaço com os bancos traseiros rebatidos.

No interior, havia uma nova unidade de infotainment, chamada MMI, que integrava a navegação, controles de aquecimento e ventilação e unidade de áudio. Era um sistema tudo-em-um acessível por meio de um botão giratório no console central, com poucos botões ao redor.

O motor V10 de 5,2 litros estava na prateleira e já chegou ao modelo A8. Mas os engenheiros não queriam dar ao S6 o mesmo poder do modelo principal. Então, eles dessintonizaram para 440 hp. Para a transmissão, uma caixa de câmbio Tiptronic de 6 velocidades foi fornecida pela ZF e um diferencial central Torsen com uma distribuição de torque 40:60 foi colocado para melhorar a experiência de condução.