Um modelo Z3 de alto desempenho foi introduzido pela BMW em 1998, o M Roadster.
Além dos motores mais potentes - unidades de 3,2 litros emprestadas dos modelos M3 atualizados com 321 cv - o novo M Z3 Roadster apresentava um sistema de escape redesenhado, uma carroceria aerodinâmica, frenagem revisada e uma nova transmissão. Este modelo estava disponível para europeus e norte-americanos. Os modelos norte-americanos receberam uma atualização do motor em 2001, sendo equipados com uma potente unidade 3.2L S54 de 315 cv e uma transmissão manual de 5 velocidades. O BMW Z3 M Roadster foi descontinuado em 2002, depois de ter sido produzido em cerca de 15.000 unidades.