Após um início lento no mercado, a Chrysler lançou uma segunda geração do Neon em 1999 como um ano modelo 2000, após apenas quatro anos desde que o primeiro Neon foi lançado na linha de montagem.
A ideia de um sedã econômico, esportivo e jovem oferecido pela Chrysler no mercado americano não era ruim, mas o resultado ficou muito aquém das expectativas da empresa. Honda Civic, Toyota Corolla, Volkswagen Jetta e o recém-atualizado Nissan Sentra estavam no topo das vendas, enquanto o Dodge/Plymouth Neon lutava para sobreviver no mercado.

O exterior foi aprimorado com a introdução de um novo par de faróis maiores com uma grade estreita sob o capô cruzada por uma linha cromada horizontal fina que conectava os indicadores de direção montados no interior. Na parte inferior do para-choque, foi adicionada uma ampla grade que lembrava um rosto sorridente. Infelizmente, foi mais um sorriso sombrio do que um sorriso. Uma das características que fez o carro ficar bem na primeira geração foram as janelas sem moldura. Começando com o ano-modelo de 2000, o Neon apresentava os emoldurados.

No interior, a Chrysler instalou um painel de aparência decente, com um painel de instrumentos que começava acima da pilha central e se estendia até o painel da porta. Independentemente dos níveis de acabamento, não havia vidros elétricos padrão para a traseira, mas eles estavam na lista de opções. Outro problema com o Neon foi a qualidade do material. O painel, os painéis das portas, a pilha central e todas as outras superfícies eram feitas de plástico rígido.

Sob o capô, a Chrysler oferecia um motor de 1,6 litro (o mesmo encontrado na primeira geração do Mini) e duas versões de uma unidade de 2,0 litros. O poder foi para a roda dianteira através de um manual de 5 velocidades ou um automático de 4 velocidades.