Além das 100 unidades das versões cupê, a Mercedes-Benz ofereceu a série especial CLK DTM AMG com uma versão soft-top.
Depois de vender todas as versões cupê, a montadora alemã começou a trabalhar em seu primo conversível. Desta vez, ele aprendeu com seus erros, e o carro não era mais tão duro. Pelo menos, foi oferecido com assentos suficientes para conseguir alguma companhia. Além disso, o teto elétrico era a prova de que o carro gostava dos dias ensolarados e do asfalto seco.

A versão DTM AMG não se parecia com nenhum outro CLK. Além do spoiler AMG com uma grelha inferior do pára-choques em forma de A, a frente do carro apresentava uma grelha principal de três lamelas integradas no capô. Um conjunto de molduras foi aplicado nos pára-lamas dianteiros para alargar os arcos das rodas. Eles foram emparelhados com outro conjunto sobre os pára-lamas traseiros, que incluíam entradas de ar falsas. A capota era retrátil atrás dos bancos traseiros. Assim como a versão cupê, o conversível foi equipado com uma asa no topo da tampa do porta-malas.

A montadora instalou quatro assentos de fibra de carbono no carro, todos com cinto de segurança de três pontos. O painel traseiro era feito de fibra de carbono no painel de instrumentos, e os medidores apresentavam mostradores brancos e agulhas vermelhas. O CLK DTM AMG foi oferecido com um CD-Stereo como padrão, mas uma unidade de infoentretenimento mais complexa com Bluetooth e um sistema de navegação na lista de opções.

Sob o capô, a Mercedes-Benz instalou um motor supercharged de 5,4 litros, que fornecia 582 cv. Foi acoplado a uma caixa automática de 5 velocidades especialmente adaptada com patilhas atrás do volante e enviou toda a potência para as rodas traseiras através de um diferencial de deslizamento limitado.