A Nissan introduziu uma versão reestilizada para o Micra em 1998 e melhorou-o em todos os sentidos, começando com o visual exterior e terminando com as motorizações.
A Nissan viu uma oportunidade em veículos pequenos quando apresentou o Micra e tentou manter sua vantagem ao longo dos anos. Mas Renault, Peugeot-Citroen, Fiat, Opel e Volkswagen estavam lá para conquistar uma fatia do mercado. Mas a Nissan não era uma montadora nova nem inexperiente nesse segmento e provou isso quando atualizou o Micra.

Do lado de fora, o Micra de 1998 parecia muito semelhante à versão sem facelift. Ele apresentava um novo painel frontal com um par de grades com aparência de folhas separadas por uma ripa vertical que sustentava o logotipo da marca. As portas traseiras eram estreitas, mas graças ao seu amplo sistema de abertura permitiam uma entrada e saída adequada do carro. Graças aos seus cantos arredondados e arestas mais suaves, o Micra 5 Portas conseguiu encaixar-se na tendência do biodesign.

Por dentro, a Nissan fez algumas mudanças, principalmente na qualidade do material. A forma arredondada do painel e o painel de instrumentos oval foram considerados chiques e modernos. Na parte de trás, o encosto rebatível em peça única aumentou a área do porta-malas.

Sob a pele, o Micra de 1998 foi drasticamente melhorado. Junto com seus motores a gasolina atualizados, a Nissan também instalou um motor a diesel comprado da Peugeot. A montadora japonesa ofereceu uma caixa de câmbio CVT, que estava disponível para versões de motor selecionadas.