A Pontiac correu muito por gerações de Bonneville e, depois de apenas três anos desde que apresentou a primeira geração, a montadora trouxe a terceira geração, que durou apenas três anos.
Feito como o Pontiac topo de linha no estábulo, o Bonneville já era oferecido em algumas formas de carroceria, como cupê, conversível, sedã de quatro portas e perua. Mas foi o cupê que atraiu os compradores de carros para o Bonneville, que não mudou em três anos.

O modelo de 1961 apresentava um design muito mais diferente do que o modelo original de 1958. Os designs do tema da corrida espacial desapareceram, assim como os painéis curvos e extravagantes. A geração de 1961 apresentava um design mais clean, com telas planas e linhas longas. Na dianteira, os designers mantiveram o sistema de faróis duplos posicionado horizontalmente na grade. Uma área central marcada exibia o emblema vermelho da Pontiac. De seus lados, os designers fizeram a linha lateral com um chute para cima atrás das portas e continuaram até o final dos painéis traseiros.

No interior, a Pontiac instalou um banco na frente e outro atrás. Como era o carro mais exclusivo de seu estábulo, ele parecia requintado. O estofamento de vinil foi completado pelo acabamento em nogueira do painel de instrumentos e painéis das portas. Na parte inferior da cabine, a montadora instalou painéis de porta acarpetados na mesma cor dos tapetes. O cupê apresentava ar-condicionado, rádio, direção hidráulica e freios e luzes internas.

Ao contrário do Bonneville de 1958, o modelo de 1961 apresentava duas opções de motores com 6,4 litros e 6,9 litros de cilindrada, mas com potência variando entre 235 cv e 405 cv.