O SEAT Leon FR 2006 é outra versão desportiva do Leon base, sendo equipado com algumas características exclusivas que completam o visual agressivo e o alto desempenho do carro.
Em primeiro lugar, o Leon FR tem o mesmo motor TFSI de 2,0 litros que o Golf e o Octavia, que poderia produzir 200 cavalos de potência e uma aceleração de 0 a 100 km/h em 7,3 segundos. Além disso, o fabricante espanhol instalou rodas de liga leve de 17 polegadas, um difusor de ar traseiro não funcional e um atraente pára-choques traseiro. O interior foi customizado com volante revestido em couro, alavanca de câmbio exclusiva FR e bancos esportivos.

O SEAT Leon FR 2002 foi baseado no sucesso SEAT Leon I, lançado em 1998.
Partilhava a mesma plataforma com outros veículos compactos do grupo Volkswagen, incluindo o Golf.

O caminho da Volkswagen para o mercado premium começou nos anos 80. A sua ideia era transformar a marca espanhola SEAT numa empresa de automóveis de grande volume, e a alemã preencheria a lacuna entre um carro de mercado de massas e uma empresa de automóveis premium. Mas o SEAT precisava de uma imagem mais forte no mercado, e isso poderia ter sido conseguido através de um modelo desportivo com um preço inferior ao de um Golf GTI.

Em 2002, o SEAT Leon recebeu uma versão FR. Foi baseado no SEAT Leon normal, mas com uma aparência mais forte. Foi uma evolução em relação à versão Cupra. Comparado com isso, do lado de fora, havia um para-choque dianteiro diferente e apresentava design específico de cinco rodas de liga leve de 17” de raios duplos. O nome FR significa Formula Racing. A ideia era construir uma imagem esportiva para o espanhol Em 2003, a marca lançou um troféu monomarca, a Supercopa SEAT Leon. Todos os veículos foram baseados no modelo Leon FR.

Dentro da cabine, havia espaço para cinco e assentos esportivos para os passageiros da frente. Os mostradores analógicos apresentavam agulhas vermelhas em fundo branco para os mostradores.

Debaixo do carro, havia uma suspensão totalmente independente para ambos os eixos. Apesar de alguns modelos SEAT Leon estarem equipados com um sistema de tração integral, o FR tinha apenas tração dianteira. Havia apenas um manual de seis velocidades oferecido para essa versão. Foi equipado com um motor a gasolina de 1,8 litros e 20 válvulas ou um diesel de 1,9 litros. Ambas as versões foram turbo.