Em 2005, todas as montadoras européias tiveram que mudar para os padrões de emissão Euro 4, e a Volkswagen melhorou toda a sua linha, incluindo o Polo de três portas.
Um pouco maior que a primeira geração do Golf, o Polo de três portas era uma solução para cidades lotadas. Ele contou com a plataforma PQ24, que compartilhou com o Seat Ibiza e o Skoda Fabia, para citar apenas alguns. Mas não era mais um carro barato. Ainda era econômico, mas não barato. Às vezes, é preciso um olho treinado para ver as diferenças entre uma versão de um carro com facelift e uma sem facelift. Não neste caso. O Polo 2005 (Typ 9N3) abandonou os faróis redondos duplos semelhantes ao Lupo, favorecendo o estilo do cupê-cabriolet EOS. Seu lado externo era arredondado e emergia em um lado interno mais estreito e angular. De seu lado, revelou os piscas embutidos nos retrovisores externos, uma novidade para a linha Polo. As janelas laterais traseiras eram largas e fixas, mas a maioria das versões apresentava um aparelho de ar condicionado padrão.

No interior, a montadora fez alterações menos visíveis, dependendo das opções, mas aumentou a qualidade dos materiais e introduziu novos volantes e manoplas de câmbio. A unidade de infoentretenimento foi aprimorada e oferecia conectividade Bluetooth e sistema de navegação, dependendo das opções. Havia novos volantes de inspiração esportiva disponíveis, com três raios. Sua versão de três portas era adequada para aqueles que não precisavam dos bancos traseiros além de viagens curtas, mas seu banco traseiro dobrável expandiu o espaço do porta-malas de 270 litros (9,5 pés cúbicos) para 1.030 litros (36,4 pés cúbicos). ).

Sob o capô, a montadora ofereceu uma escolha de motor muito ampla, começando com um motor a gasolina de 1,2 litro atualizado e terminando com uma unidade turbo-diesel de 1,9 litro e 130 cv. Dependendo das opções, estava disponível com transmissão manual ou automática de cinco ou seis velocidades.