Lexus a secoué les trônes de la BMW Série 3 et de la Mercedes-Benz Classe C lorsqu’elle a introduit la série IS en 1998, puis, en 2000, elle a essayé de faire de même avec leurs frères et sœurs break.
Contrairement à ses principaux rivaux, Lexus a nommé la version cinq portes “Sport Cross” car elle se situait à mi-chemin entre une berline et un break. Pourtant, il offrait plus de coffre que sa version berline à trois caisses, mais il a échangé un peu d’espace pour l’apparence générale.

De l’extérieur, l’IS Sport Cross présentait le même carénage avant que la version à quatre portes. La grande différence se situait sur les côtés et à l’arrière, où le constructeur automobile a prolongé le toit derrière les montants C et placé une vitre latérale supplémentaire. A l’arrière, l’IS 200 Sport Cross est dotée d’un hayon rehaussé d’un becquet de toit monté sur la face supérieure du pare-brise.

À l’intérieur, la Sport Cross présentait le même tableau de bord de style chronographe que sa sœur à quatre portes. Le compteur de vitesse au milieu partageait le même cadran avec les jauges pour l’ampèremètre, la température du liquide de refroidissement et un indicateur d’efficacité énergétique. A l’arrière, le constructeur a installé une banquette arrière rabattable 60/40. Le coffre offrait 340 litres (12 pieds cubes) d’espace avec tous les sièges en place et jusqu’à 620 litres (21,9 pieds cubes) avec le dossier de la banquette rabattu. Pour permettre des articles plus longs, tels que des skis ou des snowboards, le constructeur automobile a installé un siège passager avant rabattable à plat, prolongeant la longueur de chargement.

Sous le capot, Lexus a fourni le Sport Cross exclusivement avec un moteur de 3,0 litres. Lexus proposait au véhicule une propulsion arrière ou un système de traction intégrale. La première version était disponible avec une boîte automatique à cinq vitesses, tandis que la seconde était équipée d’une boîte à quatre vitesses.