Der Boxster S wurde zusammen mit seiner Boxster-Version im Jahr 2002 überarbeitet.
Es brachte einige Verbesserungen in der Motorenabteilung und eine Korrektur für die Heckscheibe.

Der Boxster 2002 kam mit neuen Motoren und neuen Optionen auf den Markt. Es hatte auch ein neues Gesicht, aber nicht so anders als die erste Generation. Und während die meisten Leute hofften, das IMS-Lagerproblem behoben zu haben, war es noch schlimmer und betraf 8 % der Autos statt nur 1 % bei den Boxsters, die vor 2000 gebaut wurden. Dies wurde durch die Verwendung von einreihigen Lagern verursacht von zweireihigen Lagern.

Von außen wies der Boxster S von 2002 eine Schürze mit drei Lufteinlässen auf, einen mehr als die Nicht-S-Version. Der mittlere wurde für einen zusätzlichen Kühler benötigt, der beim einfachen Boxster nicht verbaut war. Außerdem sah es besser aus. Die kleinen Lufteinlässe an den hinteren Kotflügeln wurden für die neue Motorenpalette als ausreichend angesehen. Eine große Verbesserung war die Einführung einer Glasheckscheibe anstelle der Kunststoffscheibe. Ein doppelter runder Auspuff wurde in der Mitte unter der hinteren Stoßstange platziert.

Das 3,2-Liter-Aggregat wurde seit 2000 in den Boxster eingebaut, aber nach dem Facelift wurde es um 10 PS verbessert und erreichte 258 PS. Er war serienmäßig mit einem 6-Gang-Schaltgetriebe oder optional mit einer 5-Gang-Tiptronic (Automatik) gekoppelt. Wie erwartet war die manuelle Version immer schneller.