Chevrolet brachte 2003 die 6. Generation des Malibu auf den Markt und entwickelte das neue Modell auf einer brandneuen Epsilon-Plattform (die die N-Plattform ersetzt und als Basis für Autos wie Opel Astra oder Cadillac BLS dient).
Der Malibu war in zwei Karosserievarianten erhältlich, dem 4-türigen Malibu und dem 5-türigen Malibu Maxx Fließheck. Der neue Malibu verfügte über einen neu gestalteten Frontgrill (der 2006 weiter modifiziert wurde) und war serienmäßig mit einem 2,2-l-Ecotec L61 I4 mit 145 PS ausgestattet. Trotz der Einstellung im Jahr 2007 produzierte GM die Malibu-Limousine noch ein Jahr unter dem Namen Malibu Classic.