Chevrolet, 2003 yılında 6. nesil Malibu’yu piyasaya sürdü ve yeni modeli yepyeni bir Epsilon platformunda geliştirdi (N platformunun yerini aldı ve Opel Astra veya Cadillac BLS gibi otomobiller için temel görevi gördü).
Malibu, 4 kapılı Malibu ve 5 kapılı Malibu Maxx hatchback olmak üzere iki gövde stiliyle mevcuttu. Yeni Malibu, yeniden tasarlanmış bir ön ızgaraya sahipti (2006’da daha fazla modifikasyona uğradı) ve 145 hp sağlayan standart 2.2 L Ecotec L61 I4 ile donatıldı. 2007 yılında üretimi durdurulmasına rağmen, GM Malibu sedanını Malibu Classic adı altında bir yıl daha üretti.