Chevrolet lanzó el Malibu de sexta generación en 2003, desarrollando el nuevo modelo en una nueva plataforma Epsilon (reemplazando la plataforma N y sirviendo como base para autos como Opel Astra o Cadillac BLS).
El Malibu estaba disponible con dos estilos de carrocería, el Malibu de 4 puertas y el hatchback Malibu Maxx de 5 puertas. El nuevo Malibu presentaba una parrilla delantera rediseñada (que sufrió más modificaciones en 2006) y estaba equipado con un motor estándar Ecotec L61 I4 de 2.2 L que entregaba 145 hp. A pesar de ser descontinuado en 2007, GM produjo el sedán Malibu por un año más bajo el nombre de Malibu Classic.