A-Serisi’nin ilk nesli için geyik stabilite testi başarısızlığıyla ilgili büyük skandaldan sonra, Mercedes-Benz sorunu çözdü ve 2001’de çok daha iyi bir versiyonla geldi.
2001 A-Serisi, 1997 modelinin başarısızlığının bedelini ödemek zorunda kaldı. Mercedes-Benz otomobil üreticisi, sorunu çözmek için tüm arabaları geri çağırdı. 2600 arabayı tamir etmek için 300 milyon DM (yaklaşık 150 milyon USD) harcandı. Montaj hatları için yeni bir proje ve modifikasyonları içeren çok büyük bir maliyetti. Ama karşılığını verdi.

2001’de Cenevre Otomobil Fuarı’nda A-Serisi makyajlı model daha uzun aks mesafesi, net farlar ve daha güçlü motorlar için bir seçenekle geri döndü. Cömert bir iç alan sunan aynı MPV görünümüne sahipti. Makyajlı modelde ayrıca Mercedes-Benz’in amiral gemisi modeli S-Serisi’nden alınan bazı malzemeler vardı. Yaklaşık 980 bileşen değiştirildi veya yeniden geliştirildi.

Araba için yeni geliştirilen özelliklerden bazıları, pencere çantaları ve ESP için, maksimum fren basıncı ve dolayısıyla acil durumlarda minimum durma mesafeleri sağlayan hidrolik Fren Yardımı ile bir iyileştirme içeriyordu.

Eski 60 beygirlik versiyonun yerini alan 75 beygirlik yeni bir turbo dizel motor mevcuttu. Yeni teknoloji daha iyi yakıt verimliliği de getirdi. Aracın yoldaki yeteneklerini kanıtlamak için A-Serisi, aracı 203 kph (126 mph) ile itebilen 2.1 litrelik bir benzinli motora sahipti.