Después del gran escándalo sobre la falla de la prueba de estabilidad de los alces para la primera generación de la Clase A, Mercedes-Benz solucionó el problema y, en 2001, presentó una versión mucho mejor.
El Clase A de 2001 tuvo que pagar el fracaso del modelo de 1997. El fabricante de automóviles Mercedes-Benz retiró todos los automóviles para solucionar el problema. Se necesitaron 300 millones de marcos alemanes (alrededor de 150 millones de dólares estadounidenses) para reparar los 2600 automóviles. Fue un costo enorme que incluyó un nuevo proyecto y modificaciones para las líneas de montaje. Pero valió la pena.

En 2001, en el Salón del Automóvil de Ginebra, el lavado de cara de la Clase A regresó con la opción de una distancia entre ejes más larga, faros claros y motores más potentes. Todavía tenía el mismo aspecto MPV que ofrecía un generoso espacio interior. El modelo remodelado también tenía algunos materiales tomados del modelo insignia de Mercedes-Benz, la Clase S. Se modificaron o rediseñaron alrededor de 980 componentes.

Algunas de las características recientemente desarrolladas para el automóvil incluyeron bolsas de ventana y una mejora para el ESP con la asistencia de frenado hidráulica, que aseguró la máxima presión de frenado y, por lo tanto, distancias mínimas de frenado en emergencias.

Estaba disponible un nuevo motor turbodiésel de 75 hp, que reemplazó a la versión anterior de 60 hp. La nueva tecnología también trajo una mejor eficiencia de combustible. Para probar las capacidades del vehículo en la carretera, el Clase A presentaba un motor de gasolina de 2.1 litros que podía impulsar el vehículo a 203 kph (126 mph).