Ende 1999 wurde der Ibiza hinsichtlich Design und Motoren stark überarbeitet.
Einige haben das Modell von 1999 als Ibiza der dritten Generation angesehen, und das aus gutem Grund.

Als Teil der VW-Familie verfügte der neue Ibiza über ein völlig neues Innendesign mit VW-Qualitätsoberflächen. Das brandneue Armaturenbrett war für den Fahrer schön abgewinkelt, während sich alle Bedienelemente großartig anfühlten. Alles war schön platziert und die Gesamtqualität der verwendeten Materialien war für einen Supermini ungewöhnlich.

Der neue Seat Ibiza war mit einem neuen geteilten Kühlergrill und aufgefrischten Rücklichtern sowie überarbeiteten funky Rücklichtern ausgestattet. Die neu gestalteten Stoßfänger waren jetzt mit schwarzen Zierleisten versehen, um sie vor Kratzern zu schützen. All diese Änderungen zusammen mit den 16-Zoll-Leichtmetallrädern gaben dem Auto ein aggressiveres Aussehen als zuvor. Wenn der Ibiza der 90er nur wie eine Kiste auf Rädern aussah, hatte das Modell von 1999 ein kurviges und schlankes Design.

Der Ibiza war zwar kein schnelles Auto, hatte aber einen kleinen Spaßfaktor und fühlte sich schneller an als auf dem Papier.

Der Ibiza bot ein gutes Preis-Leistungs-Verhältnis und war neben der hervorragenden Verarbeitungsqualität mit einer serienmäßigen Klimaanlage, elektrischen Fensterhebern und einer Zentralverriegelung ausgestattet.

Alle Motoroptionen wurden von Volkswagen übernommen und die Kunden konnten zwischen zahlreichen Optionen wählen, darunter ein leistungsstarker 1,9-Liter-Diesel mit 90 PS.

Selbst mit 90 PS war der Ibiza kaum aus heißen Lukenmaterialien. Allerdings war der geringe Kraftstoffverbrauch kaum zu überbieten.

Der Ibiza war ein preisgünstiges Auto, da er günstig in der Anschaffung und im Betrieb war, sich aber trotzdem solide anfühlte und sehr gut fuhr.

Auch in Sachen Innenraum bot der Ibiza mehr als der Ford Fiesta oder der Citroen Saxo.