No final de 1999, o Ibiza foi fortemente remodelado em termos de design e motores.
Alguns consideraram o modelo de 1999 a terceira geração do Ibiza e com boas razões.

Parte da família VW, o novo Ibiza apresentou um design interior completamente novo com acabamentos de qualidade VW. O painel totalmente novo era bem inclinado para o motorista, enquanto todos os controles tinham uma ótima sensação para eles. Tudo estava bem colocado e a qualidade geral dos materiais usados era incomum para um supermini.

O novo Seat Ibiza apresentava uma nova grade dividida e lanternas traseiras atualizadas, bem como lanternas traseiras revisadas. Os pára-choques redesenhados agora apresentavam molduras pretas para protegê-los de arranhões. Todas essas mudanças, juntamente com as ligas de 16 polegadas, deram ao carro um visual mais agressivo do que antes. Se o Ibiza dos anos 90 parecia uma caixa sobre rodas, o modelo de 1999 tinha um design curvilíneo e elegante.

Embora o Ibiza não fosse um carro rápido, tinha um pouco de diversão e parecia mais rápido do que no papel.

Com boa relação custo-benefício, o Ibiza veio com ar-condicionado de série, vidros elétricos e travamento central, além da ótima qualidade de construção.

Todas as opções de motor foram herdadas da Volkswagen e os clientes puderam escolher entre várias opções, incluindo uma potente unidade Diesel de 1,9 litro com 90 cv.

Mesmo com 90 cv, o Ibiza dificilmente era um material hot hatch. No entanto, o baixo consumo de combustível foi difícil de bater.

O Ibiza era um carro econômico, pois era barato para comprar, barato para rodar, mas ainda parecia sólido e puxado muito bem.

Mesmo em termos de espaço interior, o Ibiza oferecia mais do que o Ford Fiesta ou o Citroen Saxo.