Seat führte 2006 ein Facelift für den Ibiza der dritten Generation ein und verbesserte das Auto in allen Bereichen, nicht nur äußerlich.
Die dreitürige Version war die sportliche Version mit einigen spezifischen Motoren. In der Basisversion war es auch das günstigste in der Familie. Als Mutterkonzern wollte Volkswagen nicht zu viel in den Ibiza investieren, da sich bereits die vierte Generation in der Entwicklung befand.

Für das Äußere verbesserte der Autobauer die Frontverkleidung. Darüber hinaus wurde eine neue Stoßstange mit einem aggressiveren Aussehen installiert. Darüber hinaus wurde ein A-förmiger Mittelgrill von einem Paar vertikaler Cluster anstelle der horizontalen wie beim Modell 2002-2006 flankiert. Von seiner Seite hatte das Auto je nach Ausstattungsvariante schwarze Außenspiegel und Griffe, während der Cupra der Spitzenklasse erstere in Silber und letztere in Wagenfarbe hatte.

Im Inneren gab es mit einem Budget nicht allzu viel zu tun, also blieben die meisten Teile, wie sie waren. Es gab ein paar neue Optionen für die Polsterfarbe und auf der Mittelkonsole einen CD-Player. SEAT lieferte auch Tasten am Lenkrad für das Audiosystem. Wie beim Vorgänger war der Zugang zu den Rücksitzen über die nach vorne kippbaren Vordersitze möglich.

Unter der Motorhaube stellte Volkswagen die meisten Motoren für die Plattform der kleinen Klasse zur Verfügung, die sich der Ibiza mit dem deutschen VW Polo teilt. Es lieferte nicht weniger als 13 Motoren, Benziner und Turbodiesel, die zwischen 64 und 180 PS leisteten. Letzteres war jedoch nur für die dreitürige Karosserie des Ibiza Cupra erhältlich.