Seat introdujo un lavado de cara para el Ibiza de tercera generación en 2006, mejorando el automóvil en todas las áreas, no solo en el exterior.
La versión de tres puertas era la deportiva, con algunas motorizaciones específicas. En la versión básica, también era la más asequible de la familia. Siendo su empresa matriz, Volkswagen no quería invertir demasiado en el Ibiza ya que la cuarta generación ya estaba en desarrollo.

Para el exterior, el fabricante de automóviles mejoró la fascia delantera. Además, instaló un nuevo paragolpes con un aspecto más agresivo. Además, una parrilla central en forma de A estaba flanqueada por un par de grupos verticales en lugar de los horizontales como en el modelo 2002-2006. De lado, según el nivel de equipamiento, el automóvil lucía espejos exteriores y manijas negros, mientras que el Cupra de primera línea tenía los primeros en plateado y el segundo del color de la carrocería.

En el interior, no había mucho que hacer con un presupuesto limitado, por lo que la mayoría de las partes permanecieron como estaban. Hubo algunas opciones nuevas para el color de la tapicería y, en la consola central, un reproductor de CD. SEAT también proporcionó botones en el volante para el sistema de audio. Al igual que en su predecesor, el acceso a los asientos traseros era posible a través de los asientos delanteros inclinables hacia adelante.

Debajo del capó, Volkswagen proporcionó la mayoría de los motores disponibles para la plataforma de clase pequeña compartida por el Ibiza con el VW Polo alemán. Proporcionó nada menos que 13 motores, gasolina y turbodiesel, que oscilan entre los 64 hp y los 180 hp. Sin embargo, este último solo estaba disponible en la carrocería de tres puertas del Ibiza Cupra.