Toyota presentó la segunda generación de la 4Runner a fines de 1989 con una carrocería cerrada y cuatro puertas, solucionando el problema principal de la primera generación, pero perdió la opción descapotable en el proceso.
La locura por los SUV y crossovers aún no había comenzado a principios de los años 90 cuando Toyota presentó la segunda generación. Esos eran los tiempos en que un SUV tenía que hacer frente a senderos todoterreno, nieve y caminos de barro profundo sin sudar. El fabricante de automóviles todavía lo fabricó con el mismo chasis que la camioneta HiLux, pero agregó algunas características de comodidad que hicieron de la 4Runner una excelente opción para conducir todos los días, siempre que el conductor no tuviera prisa.
Con su carrocería de cuatro puertas, la 4Runner se convirtió de la noche a la mañana en un automóvil familiar. Todavía tenía la misma apariencia robusta con su fascia delantera plana y voladizo corto. El fabricante de automóviles diseñó el parachoques delantero con un lado superior cromado y un lado inferior negro. Para aquellos que aún sentían nostalgia por la primera generación, Toyota también ofreció una versión de dos puertas, con una ventana emergente para los pasajeros traseros. El portón trasero se abrió hacia abajo en la parte trasera, como en una camioneta, con la ventana trasera enrollada hacia adentro.
En el interior, Toyota trató de hacer un interior similar al de un automóvil con una posición de asiento baja, lo que no era muy bueno en todoterreno, pero excelente en cualquier otra situación. El salpicadero era sencillo, estrecho y curvo. Lucía un amplio grupo de instrumentos extendido sobre la consola central donde el fabricante de automóviles colocó la unidad de control de clima sobre el reproductor de casetes de radio. Para los pasajeros traseros, Toyota instaló un banco plegable dividido.
Debajo del capó, Toyota instaló los mismos motores que su predecesor: un cuatro en línea y un V-6. La principal diferencia fue para el tren motriz, donde el fabricante de automóviles intercambió el eje sólido delantero más antiguo con una suspensión independiente, lo que proporcionó una conducción mucho más cómoda.
