Quando a SEAT introduziu o segundo facelift para a segunda geração do Ibiza, a Volkswagen concedeu-lhe um dos seus melhores motores de quatro cubas do mercado: o motor turbo de 1,8 litros.

Às vezes, o Cupra 1999 também era conhecido como Ibiza MK3, e é fácil entender o porquê. Seu visual era bem diferente do Ibiza de 1993. Além disso, ganhou muitas melhorias tecnológicas quando comparado a esse. O segundo facelift permitiu que a montadora espanhola mantivesse o carro no mercado até 2002, que foi mais longo do que a vida útil normal de um veículo construído nos anos 90.

O Ibiza Cupra não seguiu nenhuma linguagem de design específica. Mostrava uma frente com faróis curvos no lado interno e um acabamento em forma de nariz no meio da grade, que ostentava o emblema SEAT. Seu pára-choque apresentava um avental florido com ripas horizontais e faróis de neblina redondos no lado externo. Ao contrário de suas versões menos potentes, o Cupra apresentava arcos de roda alargados na frente e atrás e um spoiler de teto no topo da porta traseira.

No interior, a montadora se inspirou na comunidade de tuning e instalou mostradores brancos no painel de instrumentos com agulhas vermelhas. Um conjunto de pedais de alumínio perfurado e um volante mais grosso faziam parte do pacote. Seus bancos dianteiros com reforço alto ofereciam melhor apoio lateral durante as curvas de alta velocidade.

Sob o capô, a SEAT instalou um motor turbo de 1,8 litros que forneceu trinta cavalos a mais do que seu antecessor. Uma caixa manual de cinco velocidades era a única opção para este foguete de bolso de pequeno segmento.